磷酸根分析儀的工作原理是在酸性介質中，磷酸鹽與鉬酸銨、酒石酸銻鉀反應，生成磷鉬雜多酸化合物，這種化合物被抗壞血酸還原為藍色的磷鉬酸鹽，光通過測量吸光度得到水樣中磷酸鹽的含量。
磷酸根分析儀水樣測量的操作步驟：
一、儀器上電預熱儀器30分鐘以上：儀器自動進入測量界面；
二、取100mL水樣，按照標定步驟加入各種顯色試劑；
三、進行空白校準
1、按“退出”鍵，進入主菜單狀態(tài)；
2、按“▲▼??”鍵到“空白校準”；
3、按“確認”鍵進入“空白校準”菜單；
4、按照菜單提示的操作步驟注入高純水到進樣杯中，按“排污”鍵儀器將自動排污；
5、待排污指示燈熄滅，第二次注入高純水到進樣杯中；
6、待排污指示燈熄滅，第三次注入高純水到進樣杯中；
7、等待mV數(shù)穩(wěn)定時，按“?”鍵切換到“穩(wěn)定”項，；
8、按“確認”鍵儀器自動存儲穩(wěn)定后mV值，并自動退回到主菜單。空白校準就完成了，反之則重新校準。
四、水樣的測量
1、按“排污”排掉比色池中的空白水；
2、待指示燈熄滅，第一次將待測定的水樣(已加入顯色試劑進行了顯色)注入進樣杯；
3、按“排污”鍵排掉比色池中的水；
4、待指示燈熄滅，再次注入待測定的水樣(已加入各種藥劑)；當mV值穩(wěn)定時，從儀器顯示屏上直接讀取水樣的硅酸根含量。當儀器不用時，請注入高純水在比色皿中??！
